MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	CCG	2	6	29	34	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597325
2	NC_009381	GCA	2	6	51	56	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597325
3	NC_009381	ACTGG	2	10	174	183	20 %	20 %	40 %	20 %	145597325
4	NC_009381	CTTA	2	8	216	223	25 %	50 %	0 %	25 %	145597325
5	NC_009381	CA	3	6	290	295	50 %	0 %	0 %	50 %	145597325
6	NC_009381	CAGC	2	8	308	315	25 %	0 %	25 %	50 %	145597325
7	NC_009381	AC	3	6	423	428	50 %	0 %	0 %	50 %	145597325
8	NC_009381	TTG	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597325
9	NC_009381	GCC	2	6	475	480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597325
10	NC_009381	GGT	2	6	502	507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597325
11	NC_009381	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597325
12	NC_009381	TAT	2	6	691	696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597325
13	NC_009381	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597325
14	NC_009381	GAT	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597325
15	NC_009381	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	145597325
16	NC_009381	AAG	2	6	758	763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
17	NC_009381	CAG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597325
18	NC_009381	TTGG	2	8	875	882	0 %	50 %	50 %	0 %	145597325
19	NC_009381	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597325
20	NC_009381	GAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
21	NC_009381	GCCAAT	2	12	1051	1062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145597325
22	NC_009381	GATT	2	8	1083	1090	25 %	50 %	25 %	0 %	145597325
23	NC_009381	TTG	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597325
24	NC_009381	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597325
25	NC_009381	GCCC	2	8	1228	1235	0 %	0 %	25 %	75 %	145597325
26	NC_009381	AACC	2	8	1269	1276	50 %	0 %	0 %	50 %	145597325
27	NC_009381	GCCT	2	8	1280	1287	0 %	25 %	25 %	50 %	145597325
28	NC_009381	TGG	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597325
29	NC_009381	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597325
30	NC_009381	TCC	2	6	1414	1419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597325
31	NC_009381	TTG	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597326
32	NC_009381	TGGAGA	2	12	1572	1583	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	145597326
33	NC_009381	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
34	NC_009381	T	6	6	1649	1654	0 %	100 %	0 %	0 %	145597326
35	NC_009381	TTA	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597326
36	NC_009381	TGG	2	6	2050	2055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
37	NC_009381	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597326
38	NC_009381	ATTTT	2	10	2112	2121	20 %	80 %	0 %	0 %	145597326
39	NC_009381	CGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597326
40	NC_009381	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
41	NC_009381	GTG	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597326
42	NC_009381	TAA	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597326
43	NC_009381	GAA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
44	NC_009381	AGA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597326
45	NC_009381	TGAC	2	8	2445	2452	25 %	25 %	25 %	25 %	145597326
46	NC_009381	GCCA	2	8	2483	2490	25 %	0 %	25 %	50 %	145597326
47	NC_009381	GTC	2	6	2504	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597326
48	NC_009381	GTA	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597326
49	NC_009381	CTTG	2	8	2543	2550	0 %	50 %	25 %	25 %	145597327
50	NC_009381	GC	3	6	2611	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	145597327
51	NC_009381	CGCA	2	8	2621	2628	25 %	0 %	25 %	50 %	145597327
52	NC_009381	CGA	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597327
53	NC_009381	GGC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597327
54	NC_009381	T	6	6	2777	2782	0 %	100 %	0 %	0 %	145597327
55	NC_009381	GCAG	2	8	2868	2875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597327
56	NC_009381	TTA	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597327
57	NC_009381	GC	3	6	3095	3100	0 %	0 %	50 %	50 %	145597327
58	NC_009381	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	145597327
59	NC_009381	T	7	7	3137	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	145597327
60	NC_009381	AGC	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597327
61	NC_009381	CGC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
62	NC_009381	ATC	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597327
63	NC_009381	GCG	2	6	3297	3302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597327
64	NC_009381	AG	3	6	3377	3382	50 %	0 %	50 %	0 %	145597327
65	NC_009381	GTT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597327
66	NC_009381	GC	3	6	3402	3407	0 %	0 %	50 %	50 %	145597327
67	NC_009381	CCG	2	6	3439	3444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
68	NC_009381	AGA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597327
69	NC_009381	GCGG	2	8	3577	3584	0 %	0 %	75 %	25 %	145597327
70	NC_009381	GCC	2	6	3631	3636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597327
71	NC_009381	CTC	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597328
72	NC_009381	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
73	NC_009381	CAC	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597328
74	NC_009381	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
75	NC_009381	GCA	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597328
76	NC_009381	TCA	2	6	4082	4087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
77	NC_009381	CGG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597328
78	NC_009381	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
79	NC_009381	GTG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
80	NC_009381	ACT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
81	NC_009381	CT	3	6	4384	4389	0 %	50 %	0 %	50 %	145597328
82	NC_009381	TCAA	2	8	4408	4415	50 %	25 %	0 %	25 %	145597328
83	NC_009381	AGA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
84	NC_009381	GGT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
85	NC_009381	TTG	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
86	NC_009381	CCA	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597328
87	NC_009381	TGG	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
88	NC_009381	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
89	NC_009381	A	6	6	4714	4719	100 %	0 %	0 %	0 %	145597328
90	NC_009381	TGA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
91	NC_009381	TGT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
92	NC_009381	TCT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597328
93	NC_009381	CGG	2	6	4844	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597328
94	NC_009381	TGA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
95	NC_009381	GTTG	2	8	4872	4879	0 %	50 %	50 %	0 %	145597328
96	NC_009381	TTG	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
97	NC_009381	GCGG	2	8	5086	5093	0 %	0 %	75 %	25 %	145597328
98	NC_009381	CCGTAA	2	12	5109	5120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145597328
99	NC_009381	CT	3	6	5188	5193	0 %	50 %	0 %	50 %	145597328
100	NC_009381	GTT	3	9	5328	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597328
101	NC_009381	CTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597328
102	NC_009381	ATT	2	6	5365	5370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597328
103	NC_009381	GAA	2	6	5415	5420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
104	NC_009381	GAT	3	9	5446	5454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597328
105	NC_009381	CTGG	2	8	5527	5534	0 %	25 %	50 %	25 %	145597328
106	NC_009381	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
107	NC_009381	AAG	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597328
108	NC_009381	GATT	2	8	5691	5698	25 %	50 %	25 %	0 %	145597328
109	NC_009381	TGG	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
110	NC_009381	GCA	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597328
111	NC_009381	GTG	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
112	NC_009381	TGG	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597328
113	NC_009381	CGT	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
114	NC_009381	AG	3	6	6075	6080	50 %	0 %	50 %	0 %	145597328
115	NC_009381	CGT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
116	NC_009381	TGC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
117	NC_009381	CGC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597328
118	NC_009381	ACT	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597328
119	NC_009381	TCG	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597328
120	NC_009381	GC	3	6	6195	6200	0 %	0 %	50 %	50 %	145597328
121	NC_009381	ATGG	2	8	6462	6469	25 %	25 %	50 %	0 %	145597329
122	NC_009381	TGC	3	9	6521	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597329
123	NC_009381	TG	3	6	6546	6551	0 %	50 %	50 %	0 %	145597329
124	NC_009381	ATT	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
125	NC_009381	AAC	2	6	6639	6644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597329
126	NC_009381	GGC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597329
127	NC_009381	TA	3	6	6778	6783	50 %	50 %	0 %	0 %	145597329
128	NC_009381	CAA	2	6	6788	6793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597329
129	NC_009381	TGA	3	9	6895	6903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
130	NC_009381	TGA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
131	NC_009381	ATG	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597329
132	NC_009381	TAT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
133	NC_009381	GCGG	2	8	7013	7020	0 %	0 %	75 %	25 %	145597329
134	NC_009381	GCTG	2	8	7043	7050	0 %	25 %	50 %	25 %	145597329
135	NC_009381	ATT	2	6	7244	7249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597329
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264	NC_009381	AAAT	2	8	16795	16802	75 %	25 %	0 %	0 %	145597339
265	NC_009381	CGG	2	6	16865	16870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597339
266	NC_009381	GCA	2	6	16983	16988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597339
267	NC_009381	CGT	2	6	17031	17036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597339
268	NC_009381	GTT	2	6	17088	17093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597339
269	NC_009381	CCA	2	6	17135	17140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597339
270	NC_009381	CATC	2	8	17181	17188	25 %	25 %	0 %	50 %	145597339
271	NC_009381	GAA	2	6	17314	17319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597339
272	NC_009381	TCT	2	6	17322	17327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597339
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275	NC_009381	TTG	2	6	18644	18649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597340
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277	NC_009381	CCGC	2	8	18800	18807	0 %	0 %	25 %	75 %	145597340
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280	NC_009381	CAA	2	6	18845	18850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597340
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283	NC_009381	GTA	2	6	19070	19075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597340
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288	NC_009381	CTG	2	6	19598	19603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597340
289	NC_009381	TCA	2	6	19675	19680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597340
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291	NC_009381	GTA	2	6	19787	19792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597340
292	NC_009381	C	6	6	19829	19834	0 %	0 %	0 %	100 %	145597340
293	NC_009381	TTA	2	6	20013	20018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597340
294	NC_009381	GGC	2	6	20069	20074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597340
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296	NC_009381	ACC	2	6	20108	20113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597340
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298	NC_009381	CGTAA	2	10	20130	20139	40 %	20 %	20 %	20 %	145597340
299	NC_009381	GA	3	6	20147	20152	50 %	0 %	50 %	0 %	145597340
300	NC_009381	GAC	2	6	20264	20269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597340
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303	NC_009381	GCT	2	6	20574	20579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597340
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369	NC_009381	CCTG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
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373	NC_009381	ACA	2	6	25782	25787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597346
374	NC_009381	TAT	2	6	25789	25794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597346
375	NC_009381	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597346
376	NC_009381	TTCGT	2	10	25892	25901	0 %	60 %	20 %	20 %	145597346
377	NC_009381	TACT	2	8	25986	25993	25 %	50 %	0 %	25 %	145597346
378	NC_009381	G	7	7	26004	26010	0 %	0 %	100 %	0 %	145597346
379	NC_009381	ACC	2	6	26125	26130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597346
380	NC_009381	ATC	2	6	26147	26152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597346
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383	NC_009381	CTG	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597346
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386	NC_009381	GGTGA	2	10	26602	26611	20 %	20 %	60 %	0 %	145597347
387	NC_009381	CGC	2	6	26619	26624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597347
388	NC_009381	CGGCC	2	10	26694	26703	0 %	0 %	40 %	60 %	145597347
389	NC_009381	GCT	2	6	26820	26825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
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